Sabah uyandığınızda ilk işiniz bir fincan kahve içmekse, bu alışkanlık bağırsak hareketlerinizi hızlandırabilir. Kahve, sindirim sistemini uyararak bağırsak hareketlerini teşvik eder; kafein ve içerdiği diğer bileşenler bağırsaklardaki hareketliliği artırabilir. Kafeinsiz kahveler bile bu etkiye sahip olabilir çünkü sindirim sistemini tetikleyebilecek asitler ve yağlar içerir.
Gastroenterolog Kenneth Brown, kafeinin kabızlık çekenler için doğal bir çözüm olabileceğini belirtirken, bazı kişilerde ishale de neden olabileceğini vurguluyor. Ayrıca, kafein mide asidi üretimini artırarak mide ekşimesi veya asit reflüsüne yol açabilir. Kahvenin sindirim sistemi üzerindeki olumsuz etkilerini azaltmak için, tüketimi azaltmak, aç karnına içmekten kaçınmak veya farklı kahve çeşitlerini denemek gibi önerilerde bulunuluyor.